宠物鼠罗迪的奢华生活全被一只从下水道爬上来的流浪鼠西德搅了，无赖西德甚至把罗迪冲进了下水道。从没经历过世事的罗迪简直步入了噩梦一般，他光鲜的衣着和闪亮的皮鞋与肮脏的下水道城市格格不入。不过幸运的他遇到了丽塔，一个独立、勇敢、聪明、强悍的新新鼠类，更重要的是，她是个漂亮的女孩儿。                                                                      　　丽塔答应送罗迪回家，不想这个过程费尽了周折。地下世界里生活着一只妄想灭绝鼠类的疯疯癫癫的癞蛤蟆陶德。他一路对丽塔和罗迪围追堵劫。历尽千辛万苦，他们终于回到罗迪的家。然而在丽塔看来，罗迪的家虽然舒适却宛如金丝雀的鸟笼。已经对丽塔心生爱慕的罗迪该怎么办呢？他会放弃豪华的生活追随着心爱的姑娘去漂泊么？

棕熊布哥是个幸运儿，他被收养者宠得一塌糊涂，生活安逸舒适。然而现在他却被放归森林，对大自然的艰苦极不习惯的布哥一心想回城，黑尾鹿艾略特的出现却改变了他的计划。艾略特被猎人撞断了一只角，绑在车中运往镇里。布哥犹豫再三，终于救走了艾略特。这个决定让布哥再不能顺利的回到以前的生活。                                                                      　　艾略特拜恩人布哥为兄弟，跟着布哥一起前行，并且引诱他来到野丛林好好“享受”。布哥来到丛林，才发现这里的条件太恶劣了，根本不像城里舒服。而且，他们还犯了一个错误，让动物们陷入狩猎区当中，重重危险面前，布哥的野性被逐渐唤醒，他和动物们组成兵团抗击敌人，上演一场轰烈的家园保卫战。

农场里的小动物温顺乖巧。听话的小狗，可爱的小鸡，成群结队的绵羊，在农夫的细心照顾下，健康的生活着。可是，每当农夫不在的时候，他们就会突然站起来，疯狂玩闹。唱歌跳舞，喝啤酒，开Party，他们甚至会去模仿人类，捉弄人类。奶牛奥蒂斯（Otis）就是他们当中最捣蛋的一个，竟玩起了高山滑雪。奥蒂斯的父亲本（Ben）是小动物们的领袖，每天兢兢业业的为他们站岗放哨，保护小动物不受野狼的袭击。大家都敬畏并信任他。                                                                      　　本一天天的变老，他希望儿子奥蒂斯能像自己一样，担起责任，保护好农场。可是奥蒂斯玩心太重，总是令本失望。一次，奥蒂斯为了一参加个Party，求父亲替他站岗。也就是这次，本为了保护小鸡，牺牲了自己。奥蒂斯深深地自责，一度灰心丧气。本在天上看着奥蒂斯，看着他努力去做好领袖，变成真正的男人……

宝町是一座与时代发展脱节、人口密集的中型工业城市，整日响着轰隆隆机器操作的声音。小黑和小白是被称之为“猫党”的人，可以腾空在城市顶端，可以滑落在纵深空间，小黑会拿着铁棍来狂扁他不喜欢的大人，小白则有着自己天真的想象世界。宝町是一个没有将来的城市，直到一家叫“KIDDY KASTLE”的公司来到这里并想把宝町改造成他们想要的样子时，恶童们知道这是为自己的生活和城市、更是为自己的灵魂而战斗的时候了。                                                                      　　这座城市的没有规则、自由自在、清新空气、游乐设施都是属于宝町独有的！

本片是《麦兜故事》系列的第三部，由现实和动画两部分故事组成。                                                                      　　现实部分的故事开始于一次“人质挟持事件”，一群持枪匪徒闯入香港中环的国际金融中心（IFC），劫持了一家广告公司的数十名职员，在和警方对峙的关键时刻，匪徒提出要吃外卖盒饭，警方进一步调查发现此案线索涉及“春田花花幼儿园建校五十周年校庆”，而匪徒在与广告公司职员交谈时，发现某个直发披肩女孩（周笔畅）来自著名而神秘的网站春田花花幼儿园，产生好奇。而穿插在现实部分里的动画故事，春田花花幼儿园的小朋友幻想着自己将来快乐简单的理想职业生活，可是长大的他们（黄秋生、郑中基、梁咏琪等），换取温饱的方式多数变成了目标不分的随大流装傻。

在马兰山下，有一对孪生姐妹，大兰和小兰。大兰懒惰而整天与老猫玩耍，而小兰则因勤劳嫁给了山上的青年马郎，共同过着幸福的生活。然而，山上有只老狼一直渴望得到传说中的马兰花，为了过上不劳而获的生活。当小兰和马郎回家看望父母时，她们带来了丰富的礼物。大兰嫉妒之心油然而生，误会小兰头上戴的小花是传说中的神奇马兰花。大兰决定争取这朵花，以实现自己的愿望。                                                                      　　在老狼和老猫的怂恿下，大兰展开了一场争夺马兰花的行动。不幸的是，在这个过程中，由于大兰的贪婪和不顾后果，小兰不慎掉入河中。大兰意识到自己的错误，感到愧疚和内疚。当马郎出现时，大兰无奈地冒充小兰，一同登上马兰山。在这次冒险中，她经历了风吹雨打，历经千难万险，最终获得了传说中的马兰花。有了这朵神奇的花，她希望能够实现愿望，让妹妹“活过来”。

间指向了2030年，自从爆发第四次世界大战以来，各国的政治力量发生了根本性的变化，由于战乱不断，激增的难民终于获准进入日本，以填补因经济不断发展造成的劳动力短缺。而就在此时，一个自称“个别的十一人”的恐怖组织展开了一系列极端袭击事件，难民营、外国领事馆、甚至是总理都遭到了恐怖袭击……                                                                      　　难民抵抗运动的新领导人，同时也是“个别的十一人”的神秘前成员到底是谁？九课所掌握的众多线索也渐渐揭露了令人震惊的事实，在各种恐怖活动和突发事件的背后，有一人在阴影中操作着一切，他们策划的内幕是什么？九课能化解困境，并避免灾难性的内战吗？

小女孩露西期待牙齿仙子培瑞兹会拿钱来跟她交换掉落的牙齿，但培瑞兹在途中被坏蛋夏斯特跟毕波联手绑架，除了露西之外没有人相信培瑞兹出事了，毕波跟夏斯特还把绑架一事推到培瑞兹的老朋友蒙瑞提身上，他们的目标是夺走培瑞兹的船，到世界各地收集孩子们的牙齿，制造出珍珠来大赚一笔，露西在好朋友罗伯特的帮助下救出培瑞兹，查出了真相，同时也打败了坏人。

派（小弗雷迪·普林兹 Freddie Prinze Jr. 配音）是一条看上去非常不起眼的小鱼，可实际上，他出身于波斯顿最高海军部队。在一场事故中，派不幸的失去了父母，悲伤的他不愿意再留在伤心地，于是决定只身一人前往加勒比海岸。                                                                      　　在旅行的途中，派结识了超级模特科德莉亚（埃文·蕾切尔·伍德 Evan Rachel Wood 配音），两条小鱼很快就看对了眼，走到了一起。然而，当地著名的混混沙克（布莱斯·贝克汉姆 Brice Beckham 配音）一直非常想要得到科德莉亚，即便她已经名花有主，但是沙克还是不断的骚扰着她。派怎能对此坐视不管？即便对方是一条让他感到非常恐惧的鲨鱼，派还是勇敢的向沙克发起了挑战。