孤身生长于无名垃圾星的叶重，在偶然中激活了一架奇特的人工智能机甲牧殇。虽然他们一起逃离了发生星耀灾变的垃圾星，却卷入了一个个始料未及的阴谋和混乱之中，在这浩无际涯的宇宙之中，还有多少未知在等候着他？
混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化……与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——。
