自康熙十五年一场巨大的水患之后，年轻的康熙帝设科开举招纳治河贤才，二十四岁的落第举子陈潢脱颖而出，长于治河。年轻的康熙帝不拘一格，将他简拔而出。陈潢与同样有志于治河的靳辅搭档，跨越半个世纪的栉风沐雨，历经了康熙朝几次大政治风波。年轻敢言的陈潢死于奸臣结党的污蔑之下，临死前留下治河名著——《河防述要》。康熙五十一年，台湾收复，准格尔平定，黄河安澜，河水转清。康熙帝探访扬州，见到了河神庙。庙中塑着靳辅、陈潢的像，仁人志士，遗爱自在民间。
民国初年，天下局势动荡不安。少年卫斯理（吴奇隆 饰）是一个年轻而富有冒险精神的孤儿，在师父沐天恩（杜弘君 饰）的养育下长大成人，追随使命保护着清朝的皇家古墓。因为古墓密室发现的一座石棺而引起多方势力的明争暗抢，而棺中身穿金缕玉衣的妙龄少女更成了众人疑惑的不解之谜。卫斯理因这古棺的原因结识了白老大的女儿白素（阳光 饰），更是惊奇的发现，原来石棺内的女子是白素的母亲，石棺正是穿梭时空的飞行器。伴随着一次又一次惊奇冒险的生死考验下，卫斯理和白素渐生感情，而卫斯理更是在白素和白奇伟（于波 饰）兄妹的帮助下，发现了越来越多超自然的现象，而这些事情好像与卫斯理的身世之谜都有着紧密的联系。 该片改编自倪匡的同名科幻系列小说。
