出身香港社会最底层的丁小嘉（佘诗曼 饰）在考上警察后，又以卧底的身份重回鱼龙混杂的砵兰街，替CID督查康道行（欧瑞伟 饰）搜集情报。谁知在追查三合会头目游达富的犯罪事实过程中，道行意外遇害身亡。他在临死前为防止手下卧底人员身份暴露，而删除了包括小嘉在内等五名卧底的纪录。在此之后，道行的同袍刑事情报科总督察卓凯（苗侨伟 饰）联系到小嘉，希望其能协助找到其他四名卧底，并掌握外围赌博集团的犯罪证据。
法政先锋们的故事还在继续，这次的主角是法证部的高级化验师布国栋（黎耀祥 饰）。号称“人肉百科全书”的国栋知识渊博，且一直不断学习，他与法医科高级医生钟学心（张可颐 饰）既是事业上的伙伴，又是生活中的好友，共同研究工作上的疑难杂事，又互相倾诉生活中的困扰。学心的好友凌倩儿（徐子珊 饰）任职于西龙九重案组，作为高级督察的她，身手了得，和警长李展风（吴卓羲 饰）是好拍档。法医部、警界等因为各类案件而经常需要合作，而正是在他们的联努力下，一起起棘手的案件被侦破。布国栋和妻子周奕霏（胡定欣 饰）因为观念不和，最终以离婚收场，而他与学心的感情也与日俱增，学心童年悲惨的经历让他们把目光投向了新的案件上
金蛇郎君夏雪宜（江华 饰）全家被温家堡恶人所杀，前往温家寻仇的过程中与温家小姐温仪（吴美珩 饰）相爱结合生下女儿青青，却无奈温家几老利用温仪使夏雪宜重伤，温仪亦被推入井中活埋。成年后的青青（欧子欣 饰）蛮横凶恶，巧遇了袁崇焕之子袁承志（林家栋 饰），日久生情，但是袁承志却钟情于救下的弱女子阿九（佘诗曼 饰）。袁承志此时已经是金蛇郎君的徒弟，誓报父仇，金蛇郎君与五毒教妖女何红药（关宝慧 饰）之间恩怨纠缠，牵扯到了若干人等，而阿九的真正身份居然是明朝公主，李自成起义、清兵入关，国仇家恨爱恨情仇，袁承志该如何抉择？
沉迷于药理研究，后来与所在研究所理念不合，自己单独开诊所的江东健（欧阳震华 饰）是个宅心仁厚，为病人着想的好人。但由于过于痴心于自己的研究，导致他迟迟未遇见合适的对象，直到看到来诊所看病的方小芳（杨怡 饰），东健对小芳可谓一见钟情，想要在合适的日子对小芳一表心意，而小芳阴差阳错的成为了东健诊所的护士。在一次开车的过程中，东健和别的车相撞，在生命弥留之际，东健对梦中所见的恶魔求情，希望让他放过自己，让其完成未完成的事业和感情。再次睁开眼，东健奇迹的存活，再次诊病的他遇到了前来看病的人——居然就是事故的另一方邰风（林峰 饰）。最令人惊讶的是，邰风的各项生理特征表明他已死去，原来他和恶魔签订了契约，成为了死亡代理人，前来找东健复仇……
