西历5012年。突然入侵地球的＜外星人＞与其制造的＜机械生物＞导致人类面临灭亡危机。 仅存的人类逃至月球，为了夺回地球，利用＜人造人＞士兵展开反攻作战。 然而无限增加的＜机械生物＞阻挡在前，战争陷入胶著状态。 作为最终兵器，人类派遣新型人造人＜寄叶＞部队至地球。刚被派往地球的＜2B＞与先行调查员＜9S＞会合，一同执行任务，却在途中遇见许多神秘难解的现象……。 这是关于为人类而战，无生命＜人造人＞的故事－－ PS：Automata指的是“自动人形”，别再机械纪元求求了。
Emma是一个小人类女孩，生活在一个充满大生物的世界里，没有人真正知道她是什么。她正在寻找自己来自哪里，属于哪里。一路上遇到了乐于助人的朋友，比如笨拙的天才乌龟牛顿和试图证明Emma不仅仅是表面上的科学家爱德华·沃尔夫。当他们发现一整座由微小人类组成的岛屿和一个狡猾的阴谋时，他们将如何共同拯救这一天？
