本片讲述的是蝙蝠侠(罗杰·克雷格·史密斯 配音)以及罗宾联合正义联盟成员闪电侠以及绿箭侠一起对抗被称为Animilitia的犯罪组织。该犯罪组织都是由一些动物性的成员组成,包括银背大猩猩、猎豹女、杀手鳄鱼等,他们在高谭市作恶多端,一般警察对他们束手无策。而且该组织背后的主谋却指向蝙蝠侠的宿敌,同时也是高谭市叱吒风云的黑道大亨企鹅人(Dana Snyder 配音)。除了Animilitia组织,蝙蝠侠他们这次还要面对奥斯瓦德公司的商人新发明的邪恶网络动物机器人,一群犯罪恶势力再次聚集在高谭市。
在第二季中,菲灵选择牺牲使女王计划失败,女王将菲灵关入镜空间。齐娜能救回菲灵,回归以前快乐的日子吗?失去仙力的齐娜还能重拾信心吗?分别关在两个镜空间的黑香菱和封银沙,还会再见面吗?封银沙还会回到人类世界吗?建鹏和亮彩能恢复仙力吗?被女王夺走记忆变成铁希的铁皮又会怎样呢?而成为铁希主人获得叶罗丽魔法的文茜又会想出什么坏招数对付王默?回到仙境的水王子还会帮助女王吗?计划失败了的女王曼多拉是会就此放弃?还是会想出新的计划?叶罗丽仙子和叶罗丽战士们还将迎来什么新挑战?请期待叶罗丽第三季的播出。