继续展现ICAC如何锲而不舍，打击层出不穷的贪污舞弊罪行，不让繁荣稳定的香港因一小撮人而负上沉重的代价。《廉政行动二○○四》分为五个单元剧，分别是由贩卖外国护照改编的“终极斗智”、由解款车走私案改编的“不一样的赌注”、改编自首宗因身为公职人员行为不当而犯罪的“以权谋私”、廉署同一时间调查两宗涉及税务贪污案件的“猎户天龙”，以及综合所有公营房屋短桩案而成的“短桩”。
杨碧芯（惠英红 饰）饱受精神分裂困扰，差点毒害了儿子叶劲峰（王浩信 饰）。叶劲峰惊吓过度，竟解离出体弱但暖心的人格——朱玑。双重人格的叶劲峰，被刑侦之父聂山（姜皓文 饰）赏识，招揽加入特案组，与精神科医生韦睿杰（袁伟豪 饰）、拆弹警花游雁星（黄智雯 饰）、总督察江政勋（黎诺懿 饰）、法医人类学家方菀芊（王敏奕 饰）、法证昆虫专家张晓蔓（连诗雅 饰）及经常被怀疑与案件有关而需接受调查的小说编辑海蓝（菊梓乔 饰）一起恶斗种种心理偏差的高智慧罪犯，侦破多宗惊悚悬案。
