在世界几乎完全被环境灾难淹没和污染之后，只有一小部分人类能够逃到太空殖民地开普勒星球寻求救赎。在太空中度过多年后，开普勒星球面临着威胁人类的危险，太空辐射诱发了人类不育危机。为了应对这个危机，由精英宇航员布莱克领导的载人飞行任务派人去探寻地球是否能再次居住的可能性，以及人类是否还有任何延续的希望。回到地球后，布莱克震惊地发现被他们抛弃的地球上还有一群名为泥泞的幸存人类一直生活着，他们在万难的环境中幸免于难。当她试图在开普勒星球上与她的人联系时，地球却又开始发生变化……
2285年，在与可汗的战斗中损坏的联邦星舰进取号，返回了地球的太空港以进行维修。柯克还在为斯波克的死感到悲伤。麦科伊医生出现了种种异常的行为：如擅自闯入被封锁的斯波克原来的舱房、胡言乱语等，最后他被送进了医院进行精神检查。斯科提被另分派到了联邦星舰精进号。星际舰队指挥部 对新形成的创世星下达了禁入令。柯克被告知，进取号即将除役。斯波克的父亲沙瑞克找到柯克并告诉他，斯波克的遗体必须返回瓦肯星，否则他的灵魂就不得安息。沙瑞克要求柯克必须回到创世星，寻回斯波克的遗棺并将它带回瓦肯星——而斯波克临死前与麦科伊进行了心灵融合，因此带有斯波克灵魂的麦科伊也必须前往瓦肯星。可是，星际舰队拒绝让陈旧的进取号离开太空港。从医院出来后听闻消息的麦科伊，企图招募一艘飞船回到创世星。在与人争吵时他被逮捕，但这并没有影响到整个计划：在柯克、斯科特、苏鲁、乌乎拉和切科夫的帮.
阿利斯（马尔科姆•麦克道尔）是一位无恶不作的少年，他的特殊喜好是边听贝多芬的交响曲边奸淫女性，某次他进入一所别墅抢劫一番后，打残了该别墅的主人——一名小说家，并用特殊喜好蹂躏了其妻子。后来因为杀了一名单身女子，阿利斯入狱并接受了特殊的人格治疗，出狱后，他对淫乐之事产生彻底的厌倦。
该片讲述了5个来自异时空的机器魔偶，为了逃避异世界反对生物科技革命的暗杀魔爪，逃往地球，有了各自的生活，多年后，异世界又派神秘杀手暗杀的故事。而追根溯源，引发异世界生物科技革命的原因是资源濒临枯竭、环境遭到破坏，导致该空间的男子失去了生育能力。这将带给观众对保护环境，以及对人与自然关系的反思，影射了当今社会人类必须减缓对环境的破坏和污染，使其有利于人类社会生存和发展，这既保护了人类自己，同时也是科学发展观核心“以人为本”的侧面体现。整部影片主旨在于对人们保护环境的价值观的重塑，承认自然环境本身的价值，而人类作为自然界中的一份子，总结历史经验，减少自然破坏，从而达到人与自然的和谐统一。
1500年，大将军托马斯（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）奉皇后伊莎贝拉（蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰）之命前往新大陆寻找创传说中的“生命之树”。只要饮下一滴树的汁液，便会获得永生。一路历尽千辛万苦，终于到达了一座辉煌的隐蔽之地，看到了永生难忘的奇异景象。 2000年，脑癌专家汤米（休·杰克曼 Hugh Jackman 饰）急切为患脑癌的妻子丽兹（蕾切尔·薇兹 Rachel Weisz 饰）寻找良药。研究小组从南美洲丛林里带回了一株奇异的树种标本，在提炼药物用于黑猩猩实验时奇迹般地产生了效果。 2500年汤姆•乘坐着用思想控制的透明圆球飞船中，穿梭于太空宇宙。辽阔的星际间，身边却只有那棵已快死亡的古树，他无时无刻不回想着关于丽兹的记忆。 千年的奔涌时空里，苦苦寻觅的一直是生命的真谛……
高中生佐藤翼（石田卓也 饰）的生活一团糟，母亲早年去世，妹妹小爱（谷村美月 饰）自出生起便如木头人一般毫无知觉，而同年好友佐藤洋（大东俊介 饰）又对他反目成仇，暴力相向。与此同时，国内不断有姓佐藤的人因各种原因死亡，似乎他的生命也正受到威胁。在某次冲突中，翼在众人面前离奇消失，睁开眼却发现自己处于一个平行的世界。在这里，日本变成一个君主专制的国家，拥有至高无上权力的国王出于某种目的针对姓佐藤的人展开为期一周的捉迷藏游戏。佐藤们在游戏时间内必须全力逃跑，躲开鬼的追逐，一旦被抓住就只有死路一条……
